Die GMDS hat es sich zum Ziel gesetzt, die Medizinische Informatik in Theorie und Anwendung, in Forschung und Lehre zu fördern. In den GMDS Arbeitsgruppen arbeiten Praktiker aus Krankenhäusern aller Größenordnungen.

Synagon arbeitet aktiv in den Arbeitsgruppen "Informationssysteme im Gesundheitswesen" und "Medizincontrolling / Klinische Behandlungspfade" mit.

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